El exjuez Juan Fernando Alvarado López fue vinculado a proceso por su probable responsabilidad en delitos contra la administración de justicia, tras ser señalado de presuntamente otorgar beneficios irregulares al exgobernador de Tamaulipas, Francisco Javier García Cabeza de Vaca.
La determinación fue emitida por el juez Ricardo Ignacio Rivera Pacheco, adscrito al Centro de Justicia Penal Federal de Reynosa, dentro de la causa penal 45/2026.
García Cabeza de Vaca, por su parte, enfrenta diversas acusaciones por delincuencia organizada, operaciones con recursos de procedencia ilícita, tráfico de hidrocarburos y extorsión.
La causa penal contra García Cabeza de Vaca se originó por presuntas operaciones con recursos de procedencia ilícita dentro del expediente 51/2024, radicado en el Centro de Justicia Penal Federal con sede en Almoloya de Juárez, Estado de México.
En ese contexto, el entonces titular del Juzgado Séptimo de Distrito en Reynosa, Juan Fernando Alvarado López, otorgó medidas cautelares a favor del exgobernador, las cuales posteriormente fueron señaladas como irregulares.

Tras dicha resolución, el 7 de mayo de 2025, legisladores de Morena, encabezados por el diputado Sergio Luna presentaron una denuncia ante la Fiscalía General de la República al considerar que el juez habría actuado fuera del marco legal. para beneficiar políticamente al exgobernador tamaulipeco.
El diputado Sergio Gutiérrez Luna señaló que en Tamaulipas existe una red de jueces y magistrados que, según dijo, han favorecido de manera sistemática al exgobernador Francisco Javier García Cabeza de Vaca, actualmente prófugo de la justicia. En ese contexto, acusó al juez Juan Fernando Alvarado López de haber otorgado un amparo que permitió al exmandatario acceder a una candidatura, pese a resoluciones previas del Tribunal Electoral en sentido contrario.
Añadió que este juez fue suspendido por el Consejo de la Judicatura tras una queja promovida por su bancada, y pidió que se resuelva su separación definitiva del cargo. También afirmó que existen otros actores judiciales que habrían intervenido para proteger a García Cabeza de Vaca, por lo que exigió a la Fiscalía General de la República y al propio Consejo de la Judicatura actuar sin demoras para evitar, dijo, que se garantice impunidad en estos casos.
La Suprema Corte de Justicia de la Nación aprobó el 24 de febrero el proyecto de la ministra Lenia Batres, que revoca el amparo en revisión 435/2025 concedido al exgobernador de Tamaulipas, Francisco “N”, contra la segunda orden de aprehensión en su contra por los delitos de delincuencia organizada y operaciones con recursos de procedencia ilícita
El panista Francisco García Cabeza de Vaca (1967) gobernó Tamaulipas de 2016 a 2022. Ha sido señalado por la FGR por presuntos delitos de delincuencia organizada y operaciones con recursos de procedencia ilícita, donde se detectó una denuncia por más de 951 millones de pesos en bienes y recursos no explicados, y triangulaciones financieras por al menos 42 millones de pesos que habrían beneficiado al mandatario estatal y sus prestanombres a través de empresas fachada. Actualmente se encuentra en Estados Unidos ya que cuenta con doble nacionalidad, mexicana y estadounidense.